Sebastian Schäffer ist in München geboren wo er Politikwissenschaft, Europarecht und Slawistik studiert hat. Anschließend u.a. Lehrtätigkeiten an verschiedenen deutschen Universitäten.
2011 gründet er das Expertisenetzwerk SeminarsSimulationsConsulting (SSC) Europe in Berlin.
Seit 2014 lebt er in Wien und arbeitet am Institut für den Donauraum und Mitteleuropa (IDM). Seit 2019 ist er Direktor des IDM, das 2023 sein 70jähriges Jubiläum feierte.
Er ist Autor zahlreicher Artikel und Bücher, darunter “Balkan nach Europa – sofort!” (mit Erhard Busek) sowie “Ukraine & Moldau nach Europa – sofort!”, beide erschienen bei story.one. Schäffer ist zudem Herausgeber von “Ukraine in Central and Eastern Europe” bei ibidem.